Cuando se desarrolla con Visual Studio 2008, proyectos de BizTalk 2009 que referencian otros proyectos de BizTalk que estan en visual studio en una máquina que tiene BizTalk Server 2009 instalado se presenta un error de referencias al compilar o hacer deploy que se arregla con el hotfix que se encuentra en el siguiente link:
http://support.microsoft.com/kb/977428/en-us
El hotfix se debe solicitar y llega por correo electrónico.